Al llegar en 2001, el VW Polo 9N, o Polo IV, rompió con las versiones anteriores. Más imponente, es el más grande de su categoría. Estéticamente, es reconocible por su parrilla equipada con cuatro ópticas redondas, que toma prestada de su hermana pequeña, la Lupo. Está disponible en 2 carrocerías, 3 o 5 puertas, se ofrecen cuatro niveles de equipamiento, desde la versión básica (Polo) hasta la versión de lujo (Carat) pasando por una versión crossover (Dune) que permanecerá por muy poco tiempo en catálogo. Mucho más caro que sus competidores, el Polo se revisó en 2003, no para evolucionar sino para bajar de categoría y ofrecer precios de venta más asequibles. Los materiales pierden calidad, y la versión de quilates es eliminada del catálogo. Sin embargo, notamos la llegada de una versión Polo Sport, equipada con el motor 1.9l TDi 130 y acabados equivalentes a lo que se hizo en la versión de lujo. El verdadero Polo 9N de segunda generación llegó a finales de 2005. Identificable por su nueva parrilla, que ya no utiliza ópticas redondas, y sus luces traseras más modernas, armoniza con el nuevo estilo de la marca. Este polo 9N3 viene marcado por la llegada de una versión GTI, entre los 7 acabados disponibles. Esta versión está equipada con un motor gasolina 1.8 Turbo de 150cv. Después de 8 años de comercialización, finalmente fue reemplazado por el Polo V en 2009.